freebsd-updateを使うのが簡単。
6.2-RELEASEから標準となった。

# freebsd-update fetch 
# freebsd-update install 

portsツリーを最新版にする

# portsnap fetch 
# portsnap extract 

(/usr/ports/以下に展開される)

(2回目以降は)

# portsnap fetch 
# portsnap update 

portupgradeを使ってアップグレードする
portsを依存関係も考慮してアップグレードしてくれる。

# cd /usr/ports/ports-mgmt/portupgrade 
# make install clean 

全てをアップグレードする場合

# portupgrade -a