php:5.3-apache でエラーが出て起動していなかった。
pukiwiki-php-1 | AH00558: apache2: Could not reliably determine the server's fully qualified domain name, using 172.19.0.11. Set the 'ServerName' directive globally to suppress this message pukiwiki-php-1 | httpd (pid 1) already running
imageのバージョンを新しいものにしたら治りました。
version: "3" services: php: image: php:5.3-apache ↓ image: php:5.3.29-apache